Короче, легче будет воссоздать все с нуля, нежели выковыривать необходимое, я тебя понял:D
Если есть доступ к анимации, то экспортируй в формате SWF, а затем через какой-нибудь Spriter или Dragonbones конвертируй в нужный для Godot формат
