Скажи пожалуйста, а в какую версию ты играл? Сегодня я обновил файлы, и этой ошибки, когда камни не сразу берутся, уже быть не должно. Или же это дело привычки..)
А на счет драгоценных камешков - они очень маленькие, и легко узнаваемые. На них просто нужно жамкнуть или ударить, и они сразу исчезнут, а сверху появится уведомление о том, что ты нашел редкий камень. У тебя так было?