Либо поставить условие - победить всех врагов, чтобы перейти на следующий этап, либо забалансить игру так, что без опыта, который дается за убийство врагов, игроку будет не хватать прогрессии для победы над боссом/прохождении следующих этапов.
Это будет просто сильное упрощение, сначала собираешь все доступные бонусы, открываешь хилки, а потом методично всех убиваешь и элемент челленджа теряется. Это лучше реализовать как один из возможных билдов